Samkvæmt 6. gr. skipulagsskrár AkureyrarAkademíunnar kýs ársfundur stofnunarinnar sjö manna fulltrúaráð úr röðum félaga Akademíunnar, þar af þrjá í stjórn, formann, gjaldkera og ritara.
Samkvæmt 7. gr. skipulagsskrár mynda þeir fulltrúar fulltrúaráðs, sem ekki eiga sæti í stjórn stofnunarinnar, varastjórn hennar. Stjórnin fer með öll málefni stofnunarinnar milli ársfunda og ber ábyrgð gagnvart fulltrúaráði.
Stjórn starfsárið 2024- 2025:
Sigurgeir Guðjónsson, formaður, netfang sigurgeir4@gmail.com
Þórhallur S. Bjarnason, gjaldkeri, netfang tsb@simnet.is
Þorgerður Anna Björnsdóttir, ritari, netfang tab@hi.is
Aðrir í fulltrúaráði starfsárið 2024-2025:
Bryndís Fjóla Pétursdóttir, netfang bryndis@bryndis.is
Gunnar Árnason, netfang gunnararnason9@gmail.com
Jón Örn Pálsson, netfang jonpalsson@simnet.is
Margrét Guðmundsdóttir, netfang mastgumm@gmail.com